Archeologické sbírky představují význačný soubor keramických, kovových a kostěných předmětů ze všech období pravěku, z raného a vrcholného středověku (2520 inventárních čísel a cca 1500 dalších cvičebních artefaktů). Jde převážně o starší nálezy pocházející z různých darů od konce 19. století (více než 500 nádob). Řada nálezových celků pochází i z četných novějších výzkumů – např. z neolitického sídliště v Postoloprtech, z pohřebiště v Sulejovicích aj. Z nových přírůstků lze jmenovat unikatní kolekci středověkých nádob z Karolina, převedenou z archivu UK. Správou sbírky je pověřena Mgr. Zuzana Sklenářová.